企业与项目应按照创新基金申请须知的要求准备材料，包括申请书创新基金申请、可行性研究报告、专家对可行性研究报告的论证意见与名单，并按要求录制软盘；然后把这些材料送交推荐单位，由推荐单位填写推荐意见（包括书面意见与软盘）；最后按要求装订成册，邮寄到创新基金管理中心。
申报书部分
企业填写《科技型中小企业技术创新基金申请书》时必须认真阅读编写说明，并明确理解其含义。申请企业可先在计算机中安装管理中心提供的申请软件，软件及软件使用说明在《科技型中小企业技术创新基金申请材料汇总》中提供。按填写说明规定录入相关内容，并打印出完整的《科技型中小企业技术创新基金项目申请书》。
申请贷款贴息的项目，必须分别由企业开户所在地银行信贷部门和贷款审批银行（须是经中国人民银行批准的可以经营信贷业务的金融机构）在《科技型中小企业技术创新基金项目申请书》的相应栏目中签署承贷意见。创新基金可按企业申请项目借款额一年利息的50%―100%给予贴补。尚未获得银行贷款和拟向银行申请贷款的企业，须分别由开户行信贷部门和贷款审批银行在《科技型中小企业技术创新基金项目申请书》的相应栏目中签署贷款意见。项目立项后，企业应积极联系和配合所在地银行办理贷款手续。若在一年内未能提供与银行签订的项目借款合同，管理中心将取消对其贴息计划。
尤其应该注意的是：
（1）按规定要求打印；
（2）数据必须准确、实事求是，不得虚报、瞒报；
（4）正确填写企业所处阶段，并正确选择支持方式；
（5）根据企业选择的支持方式，正确填写计划投资总额等相应栏目。
可行性报告
《科技型中小企业技术创新基金项目可行性研究报告》须按《科技型中小企业技术创新基金项目可行性研究报告编制提纲》（在《科技型中小企业技术创新基金申请材料汇总》中提供）要求进行编制。该报告可以由企业自行编制，也可以委托有关中介机构编制，报告中所涉及的有关数据须与《科技型中小企业技术创新基金项目申请书》一致。报告编制完成后，由企业自行组织，或由项目推荐单位组织同行专家（三名以上）对该报告进行论证，论证意见及论证专家名单应附在《科技型中小企业技术创新基金项目可行性研究报告》后。
《科技型中小企业技术创新基金项目可行性研究报告》编制完成后，须将主要内容摘要按要求录制在申请软磁盘相应栏目中。为保证可行性报告内容的完整和详尽，不允许将软磁盘录入格式直接打印成文作为申报的《可行性报告》书面材料。专家论证意见和专家名单亦应按要求录制在申请软盘中。录入软盘的数据及主要内容必须与书面材料一致。
企业撰写《科技型中小企业技术创新基金可行性研究报告》需要注意：由于可行性研究报告是提供创新基金管理中心审查及专家评审的主要文件和依据，这份文件撰写的质量优劣，直接关系到对该项目评审结果，认真撰写此文件十分重要。为此，企业需要尤其注意以下几点：
（1）申请创新基金可行性研究报告，一定要严格按照创新基金管理中心制定的可行性研究报告提纲实事求是地撰写。
（2）应突出写明项目关键技术和共有几个创新点，创新实质是什么（例如是原理创新、结构创新、应用创新等）；写明每一点的主要内容（如技术要点、主要指标等）。
（3）要求有与国内外同类技术、产品的比较，可用文字叙述或表格的形式。
（4）可行性研究报告的撰写要求明确、翔实，尽量使其丰富，不得随意空缺或省略。
（5）可行性研究报告既可以由申请企业组织撰制，也可以委托有资质的中介机构完成。
（6）根据创新基金管理规定，可行性研究报告编制完成后，必须进行专家论证。企业可以自行组织，也可以由项目推荐单位组织，论证专家不得少于三名，专家名单附在论证意见后。
（7）可行性研究报告各栏目内容应完整，不能有缺项。
（8）可行性研究报告应有清晰、完整的目录及页码。
项目合同书
《科技型中小企业技术创新基金项目合同书》草本
为帮助申请企业了解立项后对项目实施目标的管理要求，申请企业在录入《科技型中小企业技术创新基金项目申请书》和《科技型中小企业技术创新基金项目可行性研究报告》后，可在申请软件中的合同草本功能浏览并打印出《科技型中小企业技术创新基金项目合同书》草本。《合同书》草本中的数据和内容全部取自《科技型中小企业技术创新基金项目申请书》和《科技型中小企业技术创新基金项目可行性研究报告》，若企业修改其内容，只能通过修改《申请书》或《可行性报告》中的相关内容来实现。申请企业在认真核实后，打印出《科技型中小企业技术创新基金项目合同书》草本，企业法定代表人签字并加盖公章。项目立项后，企业与管理中心签署正式的《科技型中小企业技术创新基金项目合同书》是管理中心进行项目监理和验收的依据，其中的数据将不得更改。
推荐意见表
《科技型中小企业技术创新基金项目推荐意见表》
企业提出的项目申请或投标，须经一个推荐单位推荐。推荐单位一般应在企业所在地区选择。推荐单位必须是熟悉项目及企业情况的地市以上（含地市）人民政府的科技主管部门、行业主管部门或各国家高新技术产业开发区管理委员会。
推荐单位须对企业提交材料的真实性、可靠性做出评价，并填写《科技型中小企业技术创新基金项目推荐意见表》。
《科技型中小企业技术创新基金项目推荐意见表》由推荐单位出具并加盖公章。《科技型中小企业技术创新基金项目推荐意见表》中的内容还须由推荐单位或推荐单位指定的单位按要求录入到申请软盘中，并确保录入内容与书面意见的一致性。
在录入推荐单位推荐意见之前，须先录入推荐单位信息。
申请材料附件
申请材料主要附件包括：
①企业法人营业执照（复印件）。
②经会计师事务所（或审计师事务所）审计的企业上两年度的会计报表（复印件）和相应的审计报告（复印件）,以及一个月内的企业会计报表（复印件）；会计报表包括资产负债表、损益表、现金流量表以及报表附注等。经过审计的财务报表应加盖审计单位印章。
当年注册的新办企业，须报送企业注册时的验资报告（复印件）和一个月内的企业会计报表（复印件）。
③可以说明项目情况的证明文件（如技术报告、查新报告、鉴定证书、检测报告、用户使用报告等的复印件）。
④高新技术企业认定证书（复印件）。
⑤国家专卖、专控及特殊行业的产品，须附相关主管机构出具的批准证明（复印件）。
⑥能说明项目知识产权归属及授权使用的证明文件（如：专利证书，产权使用授权书，产权使用认可书、技术合同等的复印件）。
⑦与项目和企业有关的其它参考材料(如列入国家科技计划的有关批准文件、环保证明、奖励证明、用户定单等的复印件)。
材料的装订及报送
上述书面材料加装申请材料目录后，按A4纸张尺寸，用管理中心统一提供的申请材料包装封面一式五份装订成册，同时报送录有完整信息的软磁盘一式两张，软盘标签上要注明申请企业名称和申请项目名称。
申报创新基金采用邮寄的方式。当申报企业准备好材料，并经推荐单位办理好推荐手续后，即可将全部材料和软盘寄送创新基金管理中心。创新基金管理中心受理项目申请，根据项目寄出的邮戳日期计算受理时间。创新基金管理中心不接受企业或推荐单位来人报送的材料，根据规定，对于来人报送的项目，将在项目评审（或评估）时采取减分等措施。
咨询和申请资料的获取
创新基金的有关文件、信息和资料等可从国际互联网创新基金网站上浏览；同时可向各省、自治区、直辖市、计划单列市、副省级城市科技主管部门、各国家高新技术产业开发区管理委员会咨询和购买；也可直接向管理中心指定的申请资料发行机构购买。
受理后说明
管理中心对企业提交的申请材料进行受理审查。对审查不合格的项目，管理中心一般自收到申请之日起（招标项目自招标截止之日起）两个月内，向申请（投标）企业书面发出《不受理通知书》。对发予《不受理通知书》的项目，当年不得再次申请。
受理审查合格的项目，管理中心将组织有关专家和机构对其进行立项审查或评标。立项审查未通过或未中标的项目，管理中心一般自对该项目进行受理审查之日起（招标项目自招标截止之日起）四个月内，网上通知申请（投标）企业。
企业申请材料一律不退还。申请企业可根据需要备份申请材料。
