引起新冠状肺炎(COVID-19)的新型冠状病毒(SARS-CoV-2)如何从动物传播到人类，是整个科学界试图解决的难题。悉尼大学生命与环境科学学院和医学院的进化病毒学家爱德华·霍姆斯教授是试图解开新冠状病毒来源的主要研究人员之一。自COVID-19疫情爆发以来，霍姆斯教授已撰写了四篇关于新型冠状病毒的顶级论文，包括分别发表在《自然》和《柳叶刀》上的两篇关于该病毒的最早描述，以及分别发表在《自然》和《自然医学》上的两篇关于该病毒来源的近期论文，以及发表在《细胞》杂志上的一篇评论文章。
爱德华·霍姆斯教授是悉尼大学高级进化专家/来源
众所周知，非典病毒CoV-2是导致COVID-19的病毒。了解病毒的来源将有助于其他科学家尽快找到有效的疫苗。霍尔姆斯教授一直在与中国和世界各地的科学家密切合作，以解开非典-CoV-2的遗传密码。他们的工作还将有助于监控和预防其他可能从野生动物传染给人类的病毒，导致所谓的人畜共患疾病。
病毒是自然产生的
3月17日，《自然医学》发表了一项研究，该研究由霍姆斯教授和来自加利福尼亚拉·朱莉·斯克里普斯研究所、爱丁堡大学、纽约哥伦比亚大学和新奥尔良杜兰大学的科学家合著。
这篇论文推翻了新冠状病毒是人工生物的假设。
通过对基因组数据的对比分析，研究小组发现，导致这种流行病的新冠状病毒既不是实验室制造的病毒，也不是经过故意操纵的病毒。
霍姆斯教授说:“没有证据表明非典-CoV-2是从实验室泄露的。事实上，这是一种自然疾病的出现，像我这样的研究人员已经警告了很多年。”此前，随着新皇冠肺炎疫情的蔓延，关于新皇冠病毒合成来源和实验室泄漏的谣言在互联网上广为流传。根据监督媒体对研究论文报道的组织Altmetric的分析，霍姆斯教授驳斥了新冠状病毒的合成论文，并成为历史上最高级别的学术研究。
霍姆斯教授说:“这充分表明了全球对这一话题的极大兴趣。”
华南海鲜市场不是源头
3月27日，霍尔姆斯教授与上海公共卫生临床中心、上海公共卫生临床中心和复旦大学生命科学学院的张永珍教授在《细胞》杂志上发表了题为“从基因组角度看非典-COV-2的起源和出现”的评论。
在系统整理了迄今已知的各种研究中关于新型冠状病毒的基因组数据后，评论总结了现有的结果:“从武汉华南海产品市场采集的环境样品的基因组序列现已获得。根据进化分析，它们非常接近从武汉最早的病人身上收集到的病毒。”
武汉华南海产品市场及其内部野生动物/来源:爱德华·霍尔姆斯教授评论
然而，霍姆斯教授和张永珍教授同时指出，病毒的来源可能比最初怀疑的更复杂，因为“并非所有早期的COVID19病例都与这个市场有关”。评论称，尚不清楚样本是来自经过市场的受感染人群还是来自现场的动物。然而，目前该市场缺乏明显的直接动物样本，这意味着很难做出判断。
虽然起初许多人认为这种新的冠状病毒起源于中国武汉的华南海产品市场，但后来更多的研究和分析结果也指出了更早的病毒起源。正如杜兰大学医学院教授、《自然医学》杂志的合著者之一罗伯特·加里在一次采访中所说，“武汉肯定有一些病例，但它不是病毒的来源。”
不足以证明穿山甲是中间宿主。
3月26日，《自然》杂志发表了一篇关于在穿山甲鳞片中发现类似冠状病毒的文章。研究发现，从走私入境的几种穿山甲鳞片中检出的冠状病毒与SARS-CoV-2有密切的遗传关系。
本文的作者是广西医科大学的关彝教授和胡彦领教授。霍姆斯教授也是该论文的作者之一，也是该论文中唯一的非中国学者。
这篇论文于2月20日发表在预先打印好的网站bioRxiv上。
研究小组分析了从18只马来穿山甲中提取的样本，这些样本是在2017年8月至2018年1月中国南方的反走私行动中发现的。结果，在5种穿山甲中检测到与非典相关的冠状病毒。
后来，研究人员在2018年在第二个省发现的另外12只穿山甲中的3只中检测到了类似的冠状病毒，并在2019年采集样本的第三个省发现了1只穿山甲。
文章指出，在穿山甲鳞片中发现与新冠状病毒相关的冠状病毒，属于新冠状病毒的两个亚型，一个受体结合结构域与新冠状病毒密切相关。
然而，霍尔姆斯教授说:“穿山甲病毒在非典-CoV-2出现中的作用仍然不清楚。”
2月7日，华南农业大学宣布穿山甲是新型冠状病毒的潜在中间宿主，穿山甲一夜之间成为“目标”。然而，事实上，研究人员在论文中表达的病毒基因是高度相关的，只涉及受体结合域的特定位点，而不是整个基因组。华南农业大学的研究人员也在随后的新闻发布会上解释说，这是生物信息学团队和研究实验室之间令人尴尬的沟通失误的结果。
新加坡国立大学医学院的病毒学家王林发现了非典病毒起源小组的一名成员，他也说，“即使两种病毒的受体结合域达到99%的相似性，也不足以解释两者之间的联系。”
加拿大麦克马斯特大学的冠状病毒研究员阿林杰·班纳吉说，“确定宿主的遗传相似性应该比这些研究中报道的更高。非典病毒和果子狸冠状病毒有99.8%的相同基因组，这就是为什么果子狸被认为是病毒的来源。如果穿山甲是此次疫情的源头，那么它们就不是这些研究中的穿山甲。”
尽管这种相似性并不足以表明穿山甲是直接参与当前非典-CoV-2爆发的中间宿主，但研究结果表明穿山甲是冠状病毒的第二个哺乳动物宿主，应严格禁止在野生动物市场上交易穿山甲，从而最大限度地降低未来人类感染病毒的风险。
霍姆斯教授说:“很明显，野生动物含有许多将来可能出现在人类身上的冠状病毒。一个重要的教训是，人类必须减少与野生动物的接触，比如禁止湿市场和野生动物贸易，这有助于防止这种流行病的下一次流行。
将来可能会有更多的新病毒
早期的基因组比较显示，与非典病毒最密切相关的病毒是在蝙蝠身上发现的。近年来，引起最严重传染病的非典病毒、中东呼吸综合征病毒、埃博拉病毒和马尔堡病毒都起源于蝙蝠。
然而，蝙蝠在传染性非典型肺炎-CoV-2人畜共患源中的确切作用尚未确定。
在《细胞》杂志的评论文章中，霍姆斯教授和其他人认为，非典病毒可能成为人类第五大最流行的冠状病毒，目前正在完全易感人群中传播。
研究人员说，“冠状病毒显然有能力超越物种界限，适应新的宿主，所以我们可以很容易地预测未来会有更多的新病毒。”
因此，人类需要更多的研究来帮助制定公共卫生政策，以应对类似病毒的出现。霍姆斯教授和其他人也指出了帮助防止其他冠状病毒对人类健康构成威胁的政策和其他措施，包括:1。监控各种哺乳动物的冠状病毒。众所周知，蝙蝠携带许多冠状病毒，而我们对携带这些病毒的其他物种以及它们潜伏在人类体内的可能性知之甚少。2.加强对野生动物非法贸易的监管。鉴于野生动物中病毒的多样性及其持续进化，可以说降低未来爆发风险的最简单和最具成本效益的方法是尽可能限制我们接触动物病原体。3.将哺乳动物或野生鸟类从蔬菜市场或海鲜市场移走。“很明显，野生动物含有许多冠状病毒，可能会感染人类。此次疫情的一个重要教训是，人类必须减少与野生动物的接触，比如禁止野生动物贸易。”霍姆斯教授说。参考文献:http://www . Sydney . edu . au/news-opinion/news/2020/03/27/genetics-quest-to-understand-covid-19-coronavirus . html 3月26日《自然》杂志论文:https://Www.nature.com/articles/s41586-020-2169-03, 26细胞评论:https://www.cell.com/cell/fulltext/s0098674(20)30328-73《自然医学论文:HTTPS://www . NAture . com/articles/s 4159020-0820-3/92《自然》论文:柳叶刀22/22/22
http://www . thelancet . com/journals/lancet/article/PIIS 0140-6736(20)30258/full text #
